Суммарный импульс в данном случае — да.
Да вот пример для большей наглядности.
Два одинаковых шара с одинаковыми по модулю и противоположными по направлению скоростями сталкиваются в центральном абсолютно неупругом ударе, и общий ком застывает на месте. Суммарный импульс как был нулём, так и остался. Потенциальная механическая энергия как была, так и осталась. А кинетическая обнулилась. Перешла во внутреннюю. Ну тут можно строить варианты, куда именно она перешла. Скорее всего, в тепло.
А если взять наезд одного такого шара на другой неподвижный с абсолютно неупругим ударом, то импульс сохраниться полностью, а механическая энергия лишь частично.
В нашем случае "испарится" около половины первоначальной потенциальной энергии.
Я понял, что Вы решили задачу двумя способами и получили ответ в
меньший, как если бы решать по закону сохранения энергии? Вот эта часть энергии и ушла. Если Вас интересует не само решение задачи, и именно вопрос — куда девается энергия, то можно отдельно почитать о неупругих ударах. IRL бывают разные причудливые варианты. Да и задачи я такие встречал, когда энергия хитрым способом аккумулируется в неких аккумуляторах, переходит в энергию вращения и т.п., а не тратится на обогрев.
Закон сохранения общей энергии (а не просто механической), конечно, действует во всех случаях.