2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 Мат и стат программы для биологов
Сообщение19.01.2011, 12:26 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Собственно говоря всё в названии. Кто какие знает и для каких целей использует?

Особенно интересует использование мер сходства, разнообразия и т.п.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение23.01.2011, 08:45 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Для затравки дам ссылку на обзор А.Б. Новаковского (где то в Сети был бесплатный аналог): http://elibrary.ru/item.asp?id=11788729

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 06:35 
Аватара пользователя


23/07/08
401
Новосибирск
R? Например Statistics Using R with Biological Examples

Небольшой цикл статей тут Основной автор первых двух частей цикла как раз биолог.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 15:45 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Хм... Наверное нет.
1. Должно подразумеваться, что использовать может и не спец. А здесь про сути ЯП, а не готовый продукт. По мне так довольно понятный, но для большинства биологов, которые пожелают заняться обработкой это будет сложно.
2. Как со вводом данных? Зачастую биолог собирает массу данных о видовом составе участков (это обычно Эксель). Вводить все в программу сходу обычно не вариант.
3. Как с совместимостью (я нашел, что есть win-версии)?
4. Сугубо биологических индексов и методов нет я так понимаю? Я вижу классическую статистику.

В чём преимущество например перед той же Statistica?

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение27.01.2011, 20:34 
Аватара пользователя


23/07/08
401
Новосибирск
rendall в сообщении #405294 писал(а):
В чём преимущество например перед той же Statistica?
Это разработки примерно одного класса, только R ко всему прочему ещё и свободен (идеологический наследник S).

По поводу конкретных методов сходите на CRAN и поглядите на имеющиеся там модули (зайдите в раздел Packages и просто поищите пакеты в описании которых есть, например, слово biology) — возможно то, что нужно, уже есть и придумывать велосипед не придётся. Я, кстати, не зря намекал, что основной автор цикла Шипунов — это биолог.

И да, графические «морды» к R есть в том числе и платные (например SPSS поддерживает довольно значительное подмножество R, если я правильно помню). Но лучше потратить день и таки разобраться с командной строкой, так как в будущем это вполне может сэкономить месяцы.

P.S. Я как-то слабо воспринимаю как можно заниматься анализом статистических данных в «Экселе». Это либо профанация, либо прекрасный способ растянуть время анализа до бесконечности. Что же касается экспорта данных, то R умеет экспортировать их почти отовсюду.

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение28.01.2011, 17:37 
Аватара пользователя


05/01/10
513
Владивосток
Не столько анализ сколько ввод именно в этой системе и возможно первичная обработка. Та же Statistica вполне принимет данные от Экселя.

В остальном спасибо за информацию, пойду вникать...

 Профиль  
                  
 
 Re: Мат и стат программы для биологов
Сообщение28.01.2011, 22:15 


10/11/06
64
Материалы по R А.Шипунова (биофак МГУ)

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 7 ] 

Модераторы: Karan, Toucan, PAV, maxal, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Google [Bot]


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group