По сути вопроса: обычно в методе наименьших квадратов используют не "честное" расстояние от точки до графика, а лишь разность ординат при одинаковом значении аргумента, т.е. расстояние "по вертикали".
Мне кажется, акценты не таковы. Не то, что бы это было "обычно", а так надо, и только так! Использовать "честное" расстояние было бы неверно. Так, если у вас график ток---напряжение или путь---время, то переходя от метров к километрам или от минут к милиамперам вы получите совсем другой результат! Иными словами "расстояние от точки до графика" есть в этом случае величина искусственно-неразумная.
Другое дело и другая задача, когда мы фитируем прямую (окружность, любой геом. объект) по её координатным измерениям и
обязаны минимизировать сумму квадратов
расстояний до прямой.
Собственно, оно не другое, а то же самое: и там мы смотрим расстояния "по вертикали" от точки
до "графика"
или
(последнее не есть расстояние, но при малых отклонениях пророрционально ему).