2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему На страницу Пред.  1 ... 3, 4, 5, 6, 7

Что Вас сподвигло (или сподвигло бы) к участию в проектах распределенных вычислений:
возможность помочь науке и людям 55%  55%  [ 26 ]
интересно посмотреть, что это такое и как это работает 26%  26%  [ 12 ]
за получение положительных результатов, орагнизаторы выплачивают деньги 11%  11%  [ 5 ]
есть шанс попасть в историю и прославиться 9%  9%  [ 4 ]
другое (прокомментируете свой ответ) 0%  0%  [ 0 ]
Всего голосов : 47
 
 Re: И еще раз считаем всем миром...
Сообщение26.11.2024, 13:25 


19/11/22
70
Тюмень
Молекулярный автомат

Подумал-подумал и решил, что первоначальную заметку (к тому же, написанную "для тех, кто уже участвует"), стоило бы дополнить.

Итак, в чём суть проблемы? Любой вирус - это молекулярный автомат. Это программа, воплощённая в нескольких слоях молекул образующих оболочку и начинку из РНК или ДНК.
Например - как у упоминаемого вируса Зика. Если вокруг холодно - это просто крупинка вещества. Но при подходящей температуре при столкновении с клеткой, молекулы белков его оболочки вступают в химическую реакцию с белками клеточной мембраны, "разрезают" её, внутрь клетки попадает РНК или ДНК вируса и запускается её реплицирование механизмами, существующими в клетке.
Заразив клетку, вирус превращает её в "молекулярный 3D-принтер" создающий новые копии вируса, которые, в итоге, выходят из разрушенной клетки, продолжая заражение.

Как с этим бороться? Нужно найти вещество, которое бы либо разрушало вирус, либо как-то осложняло работу его механизмов, чтобы иммунная система уже сама его окончательно бы уничтожила. При этом, это вещество не должно уничтожать все остальные живые клетки в округе, убивая организм, который надо вылечить.

Где такие вещества искать? Используя таблицу Менделеева и известные законы природы, можно создать много, очень много различных химических соединений. В зависимости от требований, уже после некоторого "просеивания" их можно получить как просто "много" - например 10^20 (десять в двадцатой степени), так и в числе, сама запись которого будет для нас непривычна - 10^60, 10^90 и т.д. Существуют и специально составленные базы с соединениями, "перспективность" которых лучше, чем какого-то совсем уж случайно сгенерированного наугад.

Используя законы Физики и Химии можно смоделировать взаимодействие молекул проверяемого соединения с молекулами мембраны вируса и понять - может ли оно его уничтожить или нейтрализовать.

А самое замечательное в том, что для подобного моделирования не требуется больших вычислительных мощностей. Оно может быть выполнено в виде отдельной задачи, работающей на одном ядре более-менее современного компьютера в течение нескольких часов. А поскольку процессоры подавляющего большинства домашних компьютеров, ноутбуков, планшетов и смартфонов, на самом деле, от 90 до 99% времени не делают ничего (можете проверить, запустив диспетчер задач), то даже запуская такую задачу в фоновом режиме и с самым низким приоритетом (чтобы она никак не мешала любым другим задачам в части задействования процессора) – можно получить огромные вычислительные мощности для проверки большого числа таких соединений. Если в этом деле будет участвовать какое-то большое число людей, которым наука интересна на самом деле.

И, (как легко понять из исходной новости) – конечно участвуют. И в разных проектах. Открывают радиопульсары, интересные математические конструкции, ищут лекарства, моделируют Вселенную, прочёсывают данные LIGO (да, тех самых гравитационно-волновых обсерваторий которые и поймали впервые гравитационные волны, принеся Кипу Торну Нобелевскую премию) в поиске гравитационные волн уже от не сливающихся, а от одиночных объектов, моделируют климат… и много чего ещё!

А иногда – с некоторой грустью и удовлетворением от выполненной работы (пусть она делается компьютером и в фоновом режиме) – провожают завершившиеся проекты. Да, вычисления идут сами – их надо только запустить и, участие в проекте – это не строительство Симплонского туннеля. Но что-то общее – есть. Пожалуй – масштаб!

P.S. Вы дочитали до конца? И вам действительно интересна наука? Тогда, возможно – вы такой же как и мы! Запускайте вычисления – [https://vk.com/page-34590225_52622420 ], присоединяйтесь к группе нашей команды - [https://vk.com/crystal_dream_team ], задавайте вопросы в группе и заходите на форум BOINC.Ru – [https://boinc.ru/forum/ ]!

 Профиль  
                  
 
 Re: И еще раз считаем всем миром...
Сообщение28.11.2024, 14:18 


19/11/22
70
Тюмень
Два проекта, Smash Childhood Cancer и Help Stop TB подходят к концу.

Smash Childhood Cancer и Help Stop TB завершили свою фазу вычислений с WCG и предоставляют нам последние новости.
Проекты: Помогите остановить туберкулез, разгромить детский рак.

Опубликовано: 26 ноября 2024 г.

Доктор Келлер из проекта Smash Childhood Cancer написал нам:

"Институт развития детской онкологической терапии благодарен Volunteers of the World Community Grid за возможность реализации проектов в сотрудничестве с доктором Тюдзи Хосино из Университета Тиба, Япония.

Самым ярким моментом этого сотрудничества стало то, что наш проект теперь является частью проекта Cancer Research UK Cancer Grand Challenge KOODAC стоимостью 25 млн. долларов США с MIT, Institut Curie, University of Dundee, Nurix Therapeutics и другими по разработке терапевтических средств для лечения детской саркомы на основе белковых деградаторов.

Программа Smash Childhood Cancer WCG также стала научной основой нескольких проектов летних стажировок, продвигая методы лечения детского рака и готовя разнообразную группу молодых людей к карьере в области науки и медицины".

Всего наилучшего команде в их будущих исследованиях.

Доктор Крофт из проекта Help Stop TB написал нам:

«Хотя проект в последнее время не был активен для новых расчетов, мы выполняли работу за кулисами, чтобы завершить расчеты, которые у нас есть, и подготовиться к сообщению результатов. Это включало исследование новых методологий XAI (объяснимый ИИ — не методы «черного ящика», а те, которые говорят нам о том, почему принимаются решения) для обработки наших отличительных наборов данных.

Поскольку миколовые кислоты уникальны по своему поведению из молекул, изученных в литературе на сегодняшний день, это означало больше работы, чем ожидалось, но мы надеемся, что вскоре все будет проанализировано с помощью новых методов.
Более того, мы искали, как повторно применить некоторые из этих методов к аналогичным сложным системам в других новых проектах группы, таких как применение к новым биологическим препаратам, чтобы лучше понять их свойства и оптимизировать производство — следите за этим пространством.

Однако, как это происходит в текущем проекте, похоже, что мы не сможем получить новые расширенные системы для следующего расчета и поэтапно запускаем в сроки, на которые мы изначально надеялись. Поэтому мы приняли решение отложить новые расчеты до тех пор, пока у нас не появится выделенный исследователь для надзора за работой, и мы сосредоточимся на завершении того, что у нас есть.

Между тем, мы хотели бы поблагодарить всех волонтеров, которые были с нами в течение последних многих-многих лет, и их неизменную поддержку проекта. Мы надеемся, что сможем предоставить вам подробную информацию о результатах и последствиях вашего вклада в ближайшем будущем."

Мы также желаем команде доктора Крофта всего наилучшего в их будущих начинаниях.

https://www.worldcommunitygrid.org/rese ... verview.do
https://www.worldcommunitygrid.org/abou ... icleId=817

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

 Профиль  
                  
 
 Re: И еще раз считаем всем миром...
Сообщение02.12.2024, 12:35 


19/11/22
70
Тюмень
Собрание и лекция на тему проектов распределённых вычислений и гражданской науки.

Очень важное значимое событие произошло в астрономическом клубе ПетрГУ - там было собрание и лекция на тему проектов распределённых вычислений и гражданской науки.

Проекты гражданской науки - это когда не компьютер автоматически обрабатывает данные, а когда сам человек за компьютером выполняет часть задания проекта, анализирует, систематизирует данные и отправляет результат.
Подробнее о мероприятии и ссылки на проекты гражданской науки здесь: https://vk.com/wall-2047015_6444
Вчера прошла очередная встреча нашего клуба, где основной темой стала гражданская наука!

Мы прослушали рассказ Ивана Терентьева о его опыте по поиску экзопланет вместе с PlanetHunters, а также поговорили и о других проектах в гражданской науке, где могут принять участие все желающие!

В приложении фрагмент лекции Ивана Терентьева (удалось записать лишь небольшую часть).

Презентация доступна по ссылке:
https://drive.google.com/file/d/1aEOTFs ... sp=sharing

⭐Вот несколько полезных ссылок по проектам:

- PlanetHunters
https://www.zooniverse.org/projects/nor ... nters-tess

- Люди науки (различные проекты по гражданской науке)
https://citizen-science.ru

- Классификация переменных звёзд GAIA
http://zooniverse.org/projects/gaia-zoo ... t/research

- Классификация галактик
https://www.zooniverse.org/projects/zoo ... alaxy-zoo/
https://galaxycruise.mtk.nao.ac.jp/en/index.html

- Поиски 9 планеты
https://www.zooniverse.org/projects/mar ... -planet-9/

- Сайт научного волонтерства
https://scistarter.org/

- Изучение климата Марса
https://www.zooniverse.org/projects/mar ... g-on-mars/

- Классификация звёзд
http://scope.pari.edu/

Приложения для обнаружения космических лучей:
- CREDO: https://credo.science/#/how-to-start
- Cosmic ray app: https://cosmicrayapp.com/
- DECO: https://www-old.wipac.wisc.edu/deco/app
- CRAYFIS: https://github.com/crayfis

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

 Профиль  
                  
 
 Re: И еще раз считаем всем миром...
Сообщение03.12.2024, 11:57 


19/11/22
70
Тюмень
2-ТРАНСВЕРСАЛИ В ПАРАХ ОРТОГОНАЛЬНЫХ ДИАГОНАЛЬНЫХ ЛАТИНСКИХ КВАДРАТОВ.

УДК 681.3 Э.И. Ватутин evatutin@rambler.com
Юго-Западный государственный университет, Курск

В работе предложено понятие 2-трансверсалей (диагональных и общего вида) в парах ОЛК/ОДЛК, показана их связь с задачей построения троек взаимно ортогональных ЛК/ДЛК и приведено краткое описание их свойств.

Латинские квадраты (ЛК) и диагональные латинские квадраты (ДЛК) представляют собой достаточно известные типы комбинаторных объектов, исследованию которых посвящено достаточно большое количество научных публикаций. Одной из наиболее известных открытых математических проблем является попытка построения тройки взаимно ортогональных ЛК/ДЛК (ВОЛК/ВОДЛК) порядка 10 N = либо доказательство ее несуществования.

Для построения ортогональных соквадратов (ОЛК/ОДЛК) к заданному квадрату наиболее эффективным является метод Эйлера-Паркера, базирующийся на построении множества трансверсалей, и последующем поиске покрытия из N попарно не пересекающихся трансверсалей (диагональных трансверсалей при поиске ОДЛК и трансверсалей общего вида при поиске ОЛК).

Введем в рассмотрение понятие 2-трансверсалей, определенных в парах ОЛК/ОДЛК. Так 2-трансверсалью в паре ОЛК/ОДЛК A и B будем называть такую трансверсаль, которая одновременно является трансверсалью как в квадрате A, так и в квадрате B.

Аналогично, диагональной 2-трансверсалью в паре ОДЛК будем называть такую диагональную трансверсаль, которая одновременно является диагональной трансверсалью в обоих ДЛК пары.

Несложно показать, что необходимым и достаточным условием существования третьего квадрата C, ортогонального обоим квадратам A и B пары, является наличие N попарно не пересекающихся 2-трансверсалей. Следовательно, при поиске тройки ВОЛК/ВОДЛК имеет смысл сконцентрироваться на целенаправленном построении пар ОЛК/ОДЛК с большим числом 2-трансверсалей, для чего необходимо исследование их свойств. Пример пары ОДЛК порядка 9 и диагональной 2-трансверсали приведен на рисунке.

00 11 22 33 44 55 66 77 88
82 53 36 08 27 60 41 15 74
46 04 17 20 65 78 52 83 31
35 87 58 61 13 24 70 06 42
28 45 64 12 76 81 37 50 03
14 68 73 47 80 32 05 21 56
57 26 01 75 38 43 84 62 10
71 30 85 54 02 16 23 48 67
63 72 40 86 51 07 18 34 25

Рис. Пример пары ОДЛК порядка 9 и диагональной 2-трансверсали [1 0 3 2 4 6 5 8 7] (выделена жирным).
Также указанная пара ОДЛК имеет еще 3 диагональных 2-трансверсали: [2 6 7 0 4 1 8 3 5], [3 5 1 8 4 7 0 2 6] и [5 3 8 1 4 0 7 6 2]

С использованием построенных ранее коллекций ОДЛК можно посчитать следующие числовые ряды для 2-трансверсалей:

• минимальное число 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 4, 10, 0, 2, 2,2, 2, 2, 2 (диагонали ДЛК по определению являются трансверсалями, поэтому для всех порядков N, для которых существуют ОДЛК, ( )2a N ³ );
• максимальное число 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 4, 10, 0, 28,96, 648, ()1028a³, ( )11
1782a³, ()12 108a³;
• мощность спектра числа 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 1, 1, 0, 3,7, 66, ()10 17a³, ( )11 35a³, () 12 42a³; и для диагональных 2-трансверсалей:
• минимальное число диагональных 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 (вероятно далее с ростом размерности N ряд будет состоять из нулевых значений);
• максимальное число диагональных 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 0, 0, 0, 14, 32, 140, ()10 8a³ , ( )11 320a³, () 12 38a³, () 13 992a³;
• мощность спектра числа диагональных 2-трансверсалей в парах ОДЛК – 1, 0, 0, 1, 1, 0, 3, 4, 53, () 106a³ , ( ) 11 37a³, ()12 11a³, () 13 14a³.

Все посчитанные числовые ряды не представлены в OEIS и планируются к добавлению в состав энциклопедии. Для порядка 11 N = ДЛК в составе рекордных пар ОДЛК являются либо циклическими, либо DSODLS/ESODLS (либо одновременно); для порядка 12 N =– по-видимому, диагонализированными составными квадратами вида 34´ с максимально возможным для данной размерности числом трансверсалей, равным 198 144 (см. числовые ряды A287644 и A344105 в OEIS).

Для порядка 10 N =рекордным числом общих 2-трансверсалей (как диагональных, так и общего вида) обладают ДЛК, являющиеся SODLS/ESODLS с относительно небольшим числом трансверсалей (124/932 и 128/932 соответственно при известных максимальных значениях 890/5504), что делает актуальной задачу бестрансверсального поиска ESODLS с использованием схем отображения ячеек CMS [1].

В перспективе при необходимости введенное определение 2-трансверсалей может быть расширено на 3-трансверсали в тройках ВОЛК/ВОДЛК, 4-трансверсали в четверках ВОЛК/ВОДЛК и т.д.

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ
1. Vatutin E.I., Zaikin O.S., Manzuk M.O., Nikitina N.N. Searching for Orthogonal Latin Squares via Cells Mapping and BOINC-Based Cube-And-Conquer // Communications in Computer and Information Science. 2021. Vol. 1510. pp. 498–512. DOI: 10.1007/978-3-030-92864-3_38.
https://boinc.ru

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 94 ]  На страницу Пред.  1 ... 3, 4, 5, 6, 7

Модераторы: Karan, Toucan, PAV, maxal, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group