Коронавирус

[Genaa]

(Оффтоп)

ozheredov в сообщении #1543305 писал(а):

и вот опять

так и я о том же. Отбор всё и отберёт:)) Пока не останется то, что способно держать такие удары судеб. И да, так и раньше было. Короче, спасут свой мир "эффективные менеджеры" от неприятных последствий стратегического насморка (для экономики, вестимо) – будет их "грудь в крестах". Не спасут – будут их "головы в кустах" (растущих окрест роскошных вилл). Се ля ви. Грядёт новейшее время 2.

[wrest]

Genaa Политико-экономические [по]следствия сабжа интересны. Но офтопичны. Давайте сожмем волю в кулак и не будем [их обсуждать] :)

[Genaa]

wrest в сообщении #1543308 писал(а):

Давайте сожмем волю в кулак и

Согласен. Но по теме есть злобный вопрос. Доколе в пандемию особо одаренная публика будет летать по миру? Как валькирии. Я ещё могу понять американцев, им все равно надо куда-то все время летать, но наши-то, наши -то скрепоносцы за каким бесом по белу свету шастают аки неуловимые Джо? Привозят очередные штаммы с драгих курортов, а потом остальные массы получают от них подарки вирусные на Рождество? Может им лучше пока в Сибири медведей пугать? В отпуске. Вот это меня сильно огорчает. Таки доколе? Это конкретно медицинская проблема.Вроде известны случаи длительного вирусоносительства. До 11 месяцев какую-то тётку изучали. На предмет проживания в ея телесах оного вирусяки. Потому простой карантин для прилетающих может не сработать. И каковы перспективы у иных средств защиты, типа надёжных и дешёвых индивидуальных средств защиты? Лучше чем существующие, прости господи, намордники. "Наномасок" на горизонте не видно? Из новых материалов. И ещё вопрос. Если новый штамм вытесняет старые, может и впрямь "британским учёным" пора уже соорудить относительно безопасный штамм, опасный для более опасных старых? Или пока что легче научить осла читать Коран?

[wrest]

Genaa в сообщении #1543310 писал(а):

Если новый штамм вытесняет старые, может и впрямь "британским учёным" пора уже соорудить относительно безопасный штамм, опасный для более опасных старых?

Тут ключевое "относительно безопасный", потому что вы же говорите о способном к размножению вирусе, испытаниях его, ессно, на людях и т.п.? Ну дык может примерно этим, в том числе, и занимались "британские ученые" (и занимаются) лаборатории в Солсбери, китайские ученые в Ухане и т.п.

-- 17.12.2021, 16:21 --

Genaa в сообщении #1543310 писал(а):

"Наномасок" на горизонте не видно? Из новых материалов.

Скорее изобретут противовирусное лекартсво прямого действия (хотя пока и не получалось) как мне кажется.
С другой стороны, вот уже есть назальные вакцины. Это примерно как ваши "наномаски".

-- 17.12.2021, 16:26 --

Genaa в сообщении #1543310 писал(а):

за каким бесом по белу свету шастают аки неуловимые Джо?

Я не понимаю, чесговоря, а почему нет. Привился - и вперёд. Не стоит, все-таки, против головной боли применять гильотину. По тяжести течения, для привитых заражение ковидом проходит сильно легче того же гриппа (если от гриппа не привит -- иной раз может быть весьма неприятно).

[Genaa]

wrest в сообщении #1543324 писал(а):

Привился - и вперёд

Увы, согласно приведенному тут ранее опусу одного сурового доктора:

Цитата:

Vaccination for COVID appears to make it more likely that the person will be completely asymptomatic, if they become infected. However, we know that they will shed just as much virus, but for a slightly shorter period of time.

[wrest]

Genaa в сообщении #1543330 писал(а):

Увы, согласно приведенному тут ранее опусу одного сурового доктора:

Это не "увы", это наоборот хорошо и показывает эффективность прививок. Вы хотите предъявить претензии тем, кто привился в том, что они заражают тех, кто НЕ привился? Спустя джва года после старта прививочной кампании и широкой доступности прививок? Ну кстати масочный режим не отменён, маски от этого помогают (эффективность более 90%). Тут привитых (как и НЕ привитых) можно обвинять в неношении масок. Это да. А в том что они, будучи привитыми, куда-то там поехали (и заразились), ну такое себе обвинение...
Попытки сдерживания какого-то штамма могут быть полезны для выигрывания времени на запуск новой вакцины. Так в Гамалеи сказали что у них уже готово, теперь процедуры допуска нужно пройти.

Я вот для себя, привитого, не ощущаю никакой угрозы со стороны привитых которые куда-то там съездили, при условии что они продолжают носить маску. То есть для меня в принципе человек с маской, нормально одетой, не представляет угрозы.

Вот давеча ребенок вирусоносил. Причем явно не только ковид но и какое-то ещё сезонное ОРВИ. Пришлось этим ОРВИ поболеть, а куда от детей денешься...

[Genaa]

Нет, я понимаю, мол, черт с ними, непривитыми. Однако в лучший мир от модных соплей попадают и привитые! А с новыми штаммами (букв ещё много, в конце концов, и финикийский алфавит может пригодится) так и вполне может оказаться , не дай бог, но и в порядке той же очереди, а то и вне очереди! Всяко может быть. Не лучше ли подождать годик, два? До выяснения на других…

[Dmitriy40]

Genaa в сообщении #1543310 писал(а):

Если новый штамм вытесняет старые, может и впрямь "британским учёным" пора уже соорудить относительно безопасный штамм, опасный для более опасных старых? Или пока что легче научить осла читать Коран?

Да, пока что это фантастика. Сейчас могут лишь подсмотреть уже существующие мутации (возможно у разных вирусов), примерно выяснить на что они влияют (причём не все!) и попытаться собрать их в кучку. Получится ли при этом более "оптимальный" (в любом смысле) вирус - непрогнозируемо, придётся испытывать на реальных людях - а это вообще говоря невозможно по этическим соображениям (никто не даст такое исследование провести).
Т.е. набрать статистику и посмотреть что на что может влиять могут, а вот предсказать что и как надо изменить и соответственно сконструировать желаемый - нет.
Есть исключение: могут обрезать "всё лишнее" и получить ослабленный в желаемом смысле. Но вот получить усиленный, который ещё нигде никогда не встречался - увы, но это и к лучшему.

Red_Herring в сообщении #1543295 писал(а):

А если надо предотвратить тяжелую форму, то надо заниматься и другими белками.

Честно говоря не вижу в этом особого смысла: если клетка производит другие белки, то она производит и S-белок, причём в разы больше всех прочих (UPD: не уверен что больше). Так что добавление [пары процентов] маркеров других белков погоды не сделает. Но могу и ошибаться, это уже лишь моё дилетантское мнение.

[Red_Herring]

Dmitriy40 в сообщении #1543338 писал(а):

если клетка производит другие белки, то она производит и S-белок

По крайней мере у Омикрона все мутации сосредоточены в S-белке и, возможно это так и с другими вариантами. И возможный подход к созданию универсальной ковидной вакцины состоит в атаке на те антигены вируса, которые мало мутируют. Возможно, такой подход сработает и против гриппа.

[Dmitriy40]

Red_Herring в сообщении #1543346 писал(а):

По крайней мере у Омикрона все мутации сосредоточены в S-белке и,

Далеко не все: из 52-55 всего в S-белке их 32-35 (точных цифр не помню), примерно 2/3:

ТАСС писал(а):

Согласно начальным данным исследований, проведенных в ЮАР, установлено, что новый штамм обладает 50 мутациями. Из них 34 находятся в белковых соединениях шипов, с помощью которых коронавирус проникает в клетки человека.

Wiki писал(а):

The Omicron variant has a total of 60 mutations compared to the original Wuhan variant: 50 nonsynonymous mutations, 8 synonymous mutations, and 2 non-coding mutations.[5] Thirty-two mutations affect the spike protein, the main antigenic target of antibodies generated by infections and of many vaccines widely administered. Many of those mutations had not been observed in other strains.[22][23] The variant is characterised by 30 amino acid changes, three small deletions, and one small insertion in the spike protein compared with the original virus, of which 15 are located in the receptor-binding domain (residues 319–541).

[Red_Herring]

Dmitriy40
Я привел цитату из биолога, работающую в той лаборатории в США, в которой они исследовали белки омикрона. И там есть ссылка на препринт большой статьи, представленной в Nature. Если вы посмотрите на ссылки в Вики, то обнаружите, что там ссылка [5] на Форбс, [22] на Файненшнел Таймс, а [23] на короткую заметку в Nature, основанную на ранних данных из ЮА, которую написал некто Ewen Callaway, и если кликните на список его публикаций, то увидите что он "писатель о науке широкого профиля".

[Dmitriy40]

Red_Herring
Однако если Вы посмотрите на GISAID, где собраны все имеющиеся официальные данные по мутациям коронавируса, отфильтруете по Clade-21K(omicron), то увидите (скриншот) что существуют три варианта с 45,46,47 мутациями, один вариант с 53 мутациями, все остальные варианты омикрона имеют 56...61 мутаций. Причём варианты с 45,46,47,53,61 и 3 варианта из 4 с 60 мутациями все были обнаружены до 6 декабря, т.е. нельзя утверждать что количество мутаций только растёт.
А по диаграмме внизу видно где именно произошли и неплохо видно что не только в S-белке, а затронуты почти все участки генома.

(Для примера список мутаций варианта с 45 мутациями:)

Mutations from root
92 nucleotide mutations, click to copy to clipboard
ORF1a: K564N, K856R, S2083-, L2084I, A2710T, T3255I, P3395H, L3674-, S3675-, G3676-, I3758V
ORF1b: P314L, I1566V, A1620V
S: A67V, H69-, V70-, T95I, G142-, V143-, Y144-, Y145D, N211-, L212I, G339D, K417N, T478K, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F
E: T9I
M: D3G, Q19E, A63T
ORF8: L118F, D119*
N: P13L, E31-, R32-, S33-, R203K, G204R
ORF9b: P10S, E27-, N28-, A29-

[Red_Herring]

Dmitriy40
В любом случае для следующего поколения вакцин надо смотреть, где мутаций нет или мало и использовать соответствующие куски белка, а не весь белок целиком. Разумеется, это долгая работа, но боюсь, Ковид с нами тоже надолго

-- 18.12.2021, 09:59 --

Сравнивая данные по Канаде и России видно, что в России количество активных случаев уменьшается, а в Канаде резко растет (Омикрон). А в России основной "двигатель" это Омикрон или всё ещё Дельта?

[Dmitriy40]

Red_Herring
Насколько мне известно во всех существующих мРНК и векторных вакцинах весь белок и не используется (в отличие от инактивированных). Вполне вероятно что какая-то часть разницы в эффективности вакцин именно с этим и связана, какие участки белка были выбраны для вакцины.
Но сам выбор сложнее, не только по частоте/вероятности мутаций (это само собой), причём не только уже обнаруженных, но и вообще возможных в принципе (методы оценки жизнеспособности разных мутаций в общем известны), но и например по тому какие участки белка не прикрыты гликанами, какие вообще доступны снаружи: например снизу, со стороны оболочки вириона, и с боков к S-белку антителу никак не подлезть, антитело в 2-10 раз длиннее всего вириона, не говоря про S-белок, остаётся доступным только верх S-белка. Да, можно "заточить" и на другие участки S-белка (в том числе и других белков из состава вириона), но тогда будут уничтожаться не вирионы, а наши клетки в которых он размножается (что менее эффективно в плане защиты). И при всём при этом надо ещё обеспечить чтобы выбранные участки не встречались у нас самих, ведь к ACE2 рецептору клеток цепляется не только коронавирус. Так что вопрос выбора сильно сложнее чем просто по наличию мутаций.

-- 18.12.2021, 18:21 --

Red_Herring в сообщении #1543433 писал(а):

А в России основной "двигатель" это Омикрон или всё ещё Дельта?

Дельта. Как говорят все случаи (27 вроде бы из ~27 тысяч всего) омикрона всё ещё завозные, распространения в стране он нигде пока не получил.

[Red_Herring]

Dmitriy40
Как Вы, очевидно, понимаете, все мы в этом вопросе "чайники", хотя и сильно заинтересованные. А вот есть профи:
https://prof-afv.livejournal.com он профессиональный вирусолог с огромным опытом и высшей квалификации; очень методичен и педентичен;
https://mary-spiri.livejournal.com она биолог, работает в лаборатории США, которая занимается в т.ч. и короной.

Dmitriy40 в сообщении #1543441 писал(а):

Дельта. Как говорят все случаи (27 вроде бы из ~27 тысяч всего) омикрона всё ещё завозные, распространения в стране он нигде пока не получил.

Похоже что это так, но непонятно почему. Согласно всем данным там коэффициент репликации 3 или больше. В Канаде он быстро становится доминантным.

В Онтарио правительство бесплатно раздает быстрые антигеновые тесты (наборы для них). Одно из мест раздачи--избранные алкомагазины. Народ тесты хватает, народу тестов не хватает.