и давление внутри капилляра будет отрицательным?
Если капилляр вогнутый, то есть жидкость смачивает стенки капилляра, то - да.
Наличие или отсутствие атмосферы - никак не влияет на капиллярное поднятие (опускание) жидкости.
Ой ли? А словосочетание "угол смачивания" и то, откуда оный угол появляется, вам о чем-нибудь говорит?
Да, угол смачивания важен, от него зависит величина поднятия или опускания уровня жидкости в капилляре, но атмосферное давление здесь ни при чем.
в англоязычном вики говорится, что в опытах не было обнаружено влияние вакуума на капиллярный подъем. Но эти опыты проводились где то в 17-18 веках и какова степень вакуума в них остается под вопросом.
Если в качестве капиллярной жидкости использовать вакуумное масло, применяемое в вакуумных насосах, то его равновесное давление пара при обычной температуре будет около 0,01 мм рт. ст., значит и вакуум был примерно такой же.