rundaНу так когда Вы все аппроксимируете, Вы и получите СЛАУ.
Например, аппроксимация Вашего уравнения колебаний имеет вид 

Это я использовал Вашу аппроксимацию второй производной по иксу.. Сам ее не проверял. Группируете в левой части все члены  с 

 слоя (по возрастанию индекса 

), а в правой части -- все остальные. Вот готово большинство уравнений СЛАУ. Остальные уравнения получатся, если аппроксимируете граничные условия с нужным порядком. Начальные условия будут нужны для заполнения столбца свободных членов.