Фундаментальные — ниоткуда, он им просто дан. Ну а составные типа протона или нейтрона (их ведь тоже часто зовут элементарными) — как сумму составляющих.
Если вопрос ещё и в том, почему у всех электронов одинаковый заряд (и масса, и т. д.), и почему они вообще неразличимы, то это потому, что они кванты одного и того же поля (электрон-позитронного). Но если такой ответ непонятен, увы, вряд ли есть проще.
Ещё вопрос мог бы быть и о том, почему электрический заряд квантован и у всех известных частиц кратен какому-то значению (уже довольно давно это
заряда электрона, который зовётся элементарным лишь по историческим соображениям и из-за того, что в обычных ситуациях нам попадаются всё-таки кратные именно его). Тут даже возможных причин не одна.