Я рассматриваю вопрос в плоскости "можно -- нельзя"
Извините, если неправильно понял Ваш исходный посыл, но мне показалось, что вопрос все-таки поставлен не как "можно-нельзя" (разумеется, можно. Можно даже создать близкую к идеальной эталонную поверхность, наверное, что-то типа графенового "листа"), а действительно как "нужно-не нужно", с точки зрения того, принесет ли больше вреда чем пользы такого рода обработка. Если нужны примеры негативного влияния снижения шероховатости, то могу посоветовать посмотреть книгу Комбалова В.С. "Влияние шероховатости твердых тел на трение и износ", где, например, указан случай поиска оптимальной шероховатости зеркала цилиндра и ее влияние на износ поршневых колец. Оказывается, что существует минимум на кривой "Шероховатость-Коэффициент трения", указывающий на существование такого оптимального значения шероховатости. Шероховатость ниже оптимальной приводит к неустойчивости масляной пленки на поверхности цилиндра, и, соответственно, более интенсивному износу колец.