Вообще-то им больно, когда над ними издеваются
Ну а на ком прикажете тестировать новые лекарства?  Как проводить исследования в области физиологии?  И т.п.
Все это, конечно, "плохо" - в том смысле, что "лучше как-то иначе".  Но до тех пор, покуда "иначе" не выльется в какую-то конкретику - опыты на животных будут ставить.
Что касается вымирания определённых видов животных, то это процесс неизбежный (выживают более устойчивые и приспособленные).
Здесь есть ньюансы.  Вымерший вид - мог бы быть чем-то потенциально полезен.  Например, у него был какой-то фермент с интересными свойствами.  С другой стороны, "устойчивые и приспособленные" - действительно пока (?) формируют новые экосистемы.  Как правило, куда более бедные видами (временно?), чем "естественные", несинантропные.  А человек получает свое "жизненное пространство"...
Наверно глупо это все оценивать в категориях морали (хорошо/плохо/мучать).  Боюсь, она в принципе неспособна ответить на подобные вопросы (и с концлагерями-то не справилась...) - мораль это продукт истории общества.  А по историческим меркам - оно только недавно сумело осознать свое влияние на экологию.  Хотя делать пустыни в масштабах целых стран и сводить леса - научилось еще на заре цивилизации.