Как можно указать в MSVS2008 какие библиотеки компоновать в релизе, а какие в дебаге?
В настройках проекта (солюшена).
А если просто переименовать "zlib.lib" в "zlibd.lib" проблемы будут?
Вполне могут быть.
Все библиотеки искать и компилить в Debug'е - слишком долго.
Но более логично.