А если так. Корабль не передаёт снаряду свою кинетическую энергию. Просто с корабля заправили двигатель снаряда антиматерией, и снаряд полетел на реактивном двигателе.
ну полетел и полетел, в чем вопрос то в данном случае? в разных исо у ативещества разная энергия

плюс по моему и энергия фотонов разная