Ну, например, Reduced Major Axis (RMA) Regression. К моему удивлению, в Google не нашёл подробного описания этого метода, хотя его идея очень проста: в нём минимизируется сумма квадратов расстояний от точек до аппроксимирующей кривой (в отличие от МНК, в котором минимизируется сумма квадратов разностей ординат точек и аппроксимирующей функции в попарно различных абсциссах точек). Метод более предпочтителен в случаях, когда погрешность могут иметь не только результаты измерений функции в какой-либо точке, но и сама координата этой точки (например, истинная температура в момент времени 10.01 сек была 12.99 градусов, а измерили 13.00 градусов, и приписали её моменту времени 10.00 сек). Однако есть в нём свои сложности. Метод RMA может выдать кривую, принимающую более одного значения в точке, т.е. не являющуюся графиком функции. Например, в линейном случае RMA вполне может выдать вертикальную линию, даже в случае, когда абсциссы всех точек попарно различны.
Добавлено спустя 17 минут 20 секунд:
Оказывается, метод RMA здесь уже обсуждался:
http://dxdy.ru/topic15175.html
Вот склероз!
Aneto, посмотрите, там много ссылок на похожие задачи.