Есть
образцов, по каждому делается по несколько измерений двумя методами. Как проверить гипотезу, что измерения разными методами одинаковые в терминах воспроизводимости измерений? Особенность в том, что отклонения могут быть в разные стороны для разных образцов.
На мой взгляд, ответ здесь уже неоднократно прозвучал, и от Евгения Машерова, и от Александровича...
Но напишу и я немножко, так как сам недавно чем-то подобным занимался.
Для каждого метода находите дисперсии измерений каждого образца, и сравниваете среднее этих дисперсий с помощью, например, Стьюдента.
Если на заданном Вами уровне значимости оно отличается, то измерения разными методами - разные, "в терминах воспроизводимости измерений",
тем более, что измерений по каждому образцу всего несколько, а не достаточно много, воспроизводимости не будет.
Если среднее дисперсий окажется одинаковым, то не будет причин не использовать дисперсионный анализ для сравнения средних (при выполнении других условий его применимости).