Сравнивать не читая сложно,так как мне показалось слишком отличаются.
Кажущееся сильное отличие отчасти вызвано тем, что последовательность тем в учебниках разная. То, что в одном учебнике даётся в 10-м классе, в другом бывает, что излагается в 11-м. И, наоборот.
более глубоко изучить математику 10-11 (начала и основы матана)
Если цель - более глубоко изучить основы матана, то берите Пратусевича. У него и задачи более интересные. А у Мордковича более получается подготовка школьника к решению стандартных задач из профильного ЕГЭ.