Наверное меня не так поняли.
Я Вас понял правильно. Используйте, как указывалось, механизм \include / \includeonly
В теле документа т.е. после \begin{document} напишите
\include{ants}
\include{beetles}
\include{batterfies}
(вместо \input)
и скомпилируйте. Теперь Вы хотите только про муравьев. Оставьте все как было, а в преамбуле т.е. до \begin{document} добавьте