Ну, по мере возможности.
Кстати, на случай, если из-за ограничения, вносимого опцией noactivechars, какая-то формула не будет переноситься корректно, можно определить команду, которая при переносе дублирует следующий за ней символ:
\def\?#1{#1\nobreak\discretionary{}{\hbox{$\mathsurround=0pt #1$}}{}}
Её нужно вставлять в то место формулы, где ожидается перенос. Но это, разумеется, "костыль".
-- Ср дек 21, 2016 13:09:39 --Новую неприятность обнаружил:
\documentclass[a4paper,12pt]{article}
\usepackage{mathtext}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{mathtools}
\usepackage[T2A]{fontenc}
\usepackage[cp1251]{inputenc}
\usepackage[russian]{babel}
\usepackage{microtype}
\usepackage{geometry} % пакет для установки полей
\usepackage[noactivechars]{rmathbr} % переносы математических формул
\geometry{top=2cm} % отступ сверху
\geometry{bottom=2cm} % отступ снизу
\geometry{left=2cm} % отступ справа
\geometry{right=2cm} % отступ слева
\begin{document}
$\angle BAC=\alpha$
\end{document}