2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки





Начать новую тему Ответить на тему На страницу 1, 2  След.
 
 Новые белки
Сообщение21.01.2017, 11:26 


03/04/14
158
Привет, биоинженерам!

А что если синтезировать несуществующие в природе последовательности аминокислот, тем самым получив новый белок?
Были ли такие эксперименты?
И возможна ли какая-то практическая польза от таких белков?

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 12:11 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


28/04/16
1106
Disclaimer: я не биоинженер.

bayah в сообщении #1186297 писал(а):
А что если синтезировать несуществующие в природе последовательности аминокислот, тем самым получив новый белок?

Ну получится в общем случае какой-то полипептид. Белок -- это не любая первичная последовательность аминокислот -- это ещё и соответствующая пространственная конфигурация, которая позволяет ему выполнять какие-то функции (каталитические, транспортные и т.д.). Подобная конфигурация есть не у каждого полипептида...
bayah в сообщении #1186297 писал(а):
Были ли такие эксперименты?

Такого добра навалом. Обычно, насколько я знаю, делают так: берут кусок ДНК от одного белка, вставляют в какое-нть место у другого ДНК, кодирующего какой-то другой белок, и вуаля, у Вас новый pen-pineapple-apple-pen белок. Так например, вроде, навешивают куски GFP и его аналогов, чтобы делать веселые вещи, типа :
Изображение
:lol:
bayah в сообщении #1186297 писал(а):
практическая польза

от таких котят, имхо, очевидна

(немножечко цитат с Лурка)

и красочно описана на Лурке:
Лурк писал(а):
Установив в квартире ультрафиолетовый фонарь, вы никогда не споткнётесь о такого кота во время ночного похода в сортир туалет. Впрочем, есть опасность не донести груз до унитаза

А вообще, эти самые "новые белки" и есть (по-сути) основа знакомых всем 3-х буковок, вызывающих у некоторых многих отвращение:

(спойлер)


 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 12:15 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


09/09/14
3775
bayah
Про это очень много написано в гугле. Если Вам интересно, потратьте 0,5 часа времени на предварительное ознакомление с информацией. Тогда или Вам перестанет быть интересно (как часто бывает с "почемучками"), или у Вас появятся более конкретные вопросы. С новыми вопросами можно будет повторить цикл. Через несколько циклов Вы либо упрётесь в сложные вещи, которые требуют спец. образования, либо поймёте, что Ваши вопросы могут быть интересны также и окружающим. Вот тогда можно прийти с ними на форум. Имхо.
(То же касается кедров, кстати.)

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 15:47 


03/04/14
158
madschumacher в сообщении #1186305 писал(а):
Такого добра навалом. Обычно, насколько я знаю, делают так: берут кусок ДНК от одного белка, вставляют в какое-нть место у другого ДНК, кодирующего какой-то другой белок, и вуаля, у Вас новый pen-pineapple-apple-pen белок.


Ну это не совсем то, тут по сути два белка сшитых вместе - этот какой-то и gfp, то есть получаем сумму функций. А имею ввиду именно получение качественное новых по функциональности белков. Ну может которые что-то такое способны делать в организме, что организм какие-то новые особенности приобретает. Паучье чутье, например!!

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 15:51 
Аватара пользователя


23/09/15
100
bayah в сообщении #1186337 писал(а):
Ну может которые что-то такое способны делать в организме, что организм какие-то новые особенности приобретает. Паучье чутье, например!!

До такого уровня биотехнологиям ещё далеко.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 18:56 


03/04/14
158
kwakush в сообщении #1186340 писал(а):
До такого уровня биотехнологиям ещё далеко.

Ну это я утрированно конечно говорю.
Имею ввиду какие-то новые белки, которые может быть какие-то функции выполняют лучше природных.
Или выполняют какие нибудь новые функции, доселе не существовавшие, но возможно полезные для какого-то организма в каких-то условиях и т.п.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 21:29 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


28/04/16
1106
bayah в сообщении #1186368 писал(а):
Имею ввиду какие-то новые белки, которые может быть какие-то функции выполняют лучше природных.

Ну так их так и получают, как монстров Франкенштейна конструтор (кусочек отсюда, отсюда, отсюда и вуаля, белок готов :wink: ). Наверное могут быть работы, в которых делали более точечные замены в первичной структуре, но я не осведомлен на эту тему. Суть в том, что даже простое сшивание 2х фрагментов не гарантирует, что фолдинг будет идти, и что требуемые свойства будут (теоретически предсказать подобное очень сложно).

Так что, насколько я понимаю, создать произвольную первичную последовательность -- не проблема, а вот сделать белок из ничего -- очень даже (непонятно что и как надо делать).

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение21.01.2017, 22:09 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


27/04/09
20017
Уфа
bayah в сообщении #1186337 писал(а):
то есть получаем сумму функций
Почему это? Пространственная конфигурация, в которую такая «сумма последовательностей» свернётся, может оказаться значительно иной. И это ещё только для конкатенации, а делать можно всякое.

bayah в сообщении #1186368 писал(а):
Или выполняют какие нибудь новые функции, доселе не существовавшие, но возможно полезные для какого-то организма в каких-то условиях и т.п.
Если добавить всего один белок, скорее всего, пользы не получится, потому что часто в одном цикле реакций участвует куча разных ферментов, порождённых ещё большей кучей генов. Вообще один и тот же фермент в разных местах разных клеток разных организмов не обязательно будет приводить к одинаковым «макроскопическим» последствиям.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение22.01.2017, 06:17 
Аватара пользователя


07/02/12
1029
Питер
bayah в сообщении #1186297 писал(а):
практическая польза

madschumacher в сообщении #1186305 писал(а):
ГМО

И животные
Изображение

bayah в сообщении #1186368 писал(а):
Имею ввиду какие-то новые белки, которые может быть какие-то функции выполняют лучше природных

Пептиды (один из самых невинных 'трюков') в спорте.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение22.01.2017, 10:03 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


28/04/16
1106
bondkim137, бельгийская голубая -- это :facepalm: Вам. Эта порода коров была выведена селекцией в XIX веке (особенно странно, что Вы ссылку на Вики привели, но даже не удосужились прочесть ее :| )...

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение22.01.2017, 15:24 
Аватара пользователя


07/02/12
1029
Питер
madschumacher, у бельгийской голубой значительно подавлена генерация собственного миостатина - белка, предназначенного для ограничения роста мышечной массы. В итоге мы имеем мутанта с полезными для нас качествами. Каким конкретно способом был создан конкретно этот мутант - вопрос второстепенный (имеются документальные случаи самопроизвольного возникновения подобной мутации в т.ч. у людей). А вот эффективная технология быстрого создания подобных мутантов путем генетического вмешательства - интересна.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение23.01.2017, 06:40 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


28/04/16
1106
bondkim137 в сообщении #1186553 писал(а):
у бельгийской голубой значительно подавлена генерация собственного миостатина - белка, предназначенного для ограничения роста мышечной массы.

А я что-то говорил противоречащее этому?! :shock:
bondkim137 в сообщении #1186553 писал(а):
Каким конкретно способом был создан конкретно этот мутант - вопрос второстепенный

Вообще-то ТС говорил:
bayah в сообщении #1186297 писал(а):
А что если синтезировать несуществующие в природе последовательности аминокислот, тем самым получив новый белок?

т.е., как я понял, его интересует именно сам способ получения (понятно, что большой полипептид методами классической химии будет собирать только или извращенец, или исследователь с неимоверной кучей свободного времени и денег и полным отсутствием воображения), т.е. методы селекции, имхо, не в кассу (тем более вопрос был про белок, а не про фенотип)...
Ну и к тому же, следуя Вашей логике, любая пара особей, зачавшая потомство, будь то дельфин и русалка или залетевшие ПТУшники -- это биоинженеры высокого класса. :lol:

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение23.01.2017, 19:03 
Аватара пользователя


07/02/12
1029
Питер

(Оффтоп)

Пожалуй, дальше, про русалок с ПТУ-шниками, можно и без меня

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение29.01.2017, 20:33 
Аватара пользователя


10/11/09
141
Пример с коровой не по теме. В этом случае не появился какой-то новый белок, а просто испорчен мутацией ген миостатина.
Старый добрый метод молекулярной генетики - "нокаут гена", с помощь которого изучают функции разнообразных белков. У подопытного организма (мухи, мыши) удаляют или повреждают определенные гены и смотрят что получится. Если выживет, конечно.

 Профиль  
                  
 
 Re: Новые белки
Сообщение05.02.2017, 22:53 
Аватара пользователя


07/02/12
1029
Питер
Добавить белок или удалить - принципиальной разницы не вижу.

(Оффтоп)

Впрочем, беседа по-моему давно утратила нить, посему пока воздержусь от участия.

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 19 ]  На страницу 1, 2  След.

Модераторы: photon, Deggial, korona, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group