2014 dxdy logo

Научный форум dxdy

Математика, Физика, Computer Science, Machine Learning, LaTeX, Механика и Техника, Химия,
Биология и Медицина, Экономика и Финансовая Математика, Гуманитарные науки




Начать новую тему Ответить на тему
 
 Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 09:20 
Аватара пользователя


01/09/13

711
Предлагаю написать предложения по развитию моей программы Chemcraft. Эта программа предназначена прежде всего для людей, занимающихся квантовой химией. Она строит трехмерные рисунки молекул, молекулярных орбиталей и пр., плюс разные графики, диаграммы и т.д.:
Изображение

Мне хотелось бы услышать советы, в каком направлении развивать программу, чтобы освоить новые ниши, в частности для неквантовых химиков. Например, программа сейчас может кое-как визуализировать кристаллографические файлы (.cif, .res). Хотелось бы знать, какое вообще будущее у кристаллографии, насколько часто она используется по сравнению с квантовой химией? И насколько актуально в этой сфере строить рисунки термальных эллипсоидов?
Ещё вопрос по квантовой химии: недавно появились новые методы учёта электронной корреляции - F12, которые позволяют указать область, в которой корреляция учитывается (чтобы, например, для металлопорфиринов считать корреляцию только в пределах атома металла). Имеет ли смысл как-то отобразить на рисунке, в каких участках молекулы считается корреляция? И какое будущее у метода F12?
Если здесь есть люди, занимающиеся биохимией, хотелось бы услышать какие там возникают задачи по визуализации (например, насколько нужно рисовать “шнуры” длинных молекул).
Программа строит рисунки молекул, но это делают и много других программ; для меня имеет смысл развивать такие возможности, как быстрое приготовление рисунков для публикаций со всеми обозначениями. Например, Chemcraft может из выходного файла извлечь малликеновские заряды на атомах и отобразить их на рисунке:
Изображение

Другое направление – рисование всевозможных графиков и диаграмм, вроде этой:
Изображение

Опять же, меня интересуют советы, где найти новые ниши в этой сфере. За посильную помощь готов предоставить лицензию.

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 16:31 
Аватара пользователя


11/06/12
10390
стихия.вздох.мюсли
Почитал описание на стартовой странице. Английский у вас хромает. И почему нет русскоязычной версии сайта?

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 17:08 
Аватара пользователя


01/09/13

711
Aritaborian в сообщении #898119 писал(а):
И почему нет русскоязычной версии сайта?


На странице Order внизу есть переход на страничку на русском. Но вообще по СНГ продаж почти нет, идут копейки. Видимо квантовая химия не востребована в России.

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 18:04 
Аватара пользователя


11/06/12
10390
стихия.вздох.мюсли
Linkey в сообщении #898136 писал(а):
На странице Order внизу есть переход на страничку на русском.
Не нашёл ;-( По-хорошему, надо бы сделать полноценную русскоязычную версию. И на главной странице два флажка-ссылки: российский и британский ;-)

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 18:13 
Аватара пользователя


01/09/13

711
Aritaborian в сообщении #898157 писал(а):
Не нашёл ;-(


http://www.chemcraftprog.com/ussr.html

Aritaborian в сообщении #898157 писал(а):
По-хорошему, надо бы сделать полноценную русскоязычную версию.


Это не окупится.

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 18:18 
Аватара пользователя


11/06/12
10390
стихия.вздох.мюсли
Linkey в сообщении #898161 писал(а):
http://www.chemcraftprog.com/ussr.html
Вы уж потрудились бы дать мне прямую ссылку (уже не нужно, я сам кликнул ;-).
Linkey в сообщении #898161 писал(а):
Это не окупится.
А кривой английский типа окупится, да? Не выёживайтесь.
Да и вообще сайт ужасен.

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 18:38 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


18/05/06
13435
с Территории
Кристаллография по размеру, может, и не больше квантовой химии, но потребителей у неё уж точно больше. (И да, эллипсоиды довольно важны.) Зато эта область и покрыта программами более плотно. Вот взять хоть Jmol: читает более-менее все основные форматы, различая тип файла по содержимому; дозволяет манипуляции с элементарными ячейками и элементами симметрии; может встраиваться в веб-страницы в виде апплета. Есть ли у Вас что-нибудь сверх этого? - тогда, может быть, есть и рыночная ниша в кристаллографии. Хотя тогда надо будет сравнить ещё с несколькими программами.
(Про заряды и орбитальки я понял, но вот их-то как раз в кристаллографии нет.)

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 19:08 
Аватара пользователя


01/09/13

711
ИСН в сообщении #898173 писал(а):
Вот взять хоть Jmol: читает более-менее все основные форматы, различая тип файла по содержимому; дозволяет манипуляции с элементарными ячейками и элементами симметрии;


Я скачал Jmol, что-то не могу найти, как отобразить увеличенную (продублированную) ячейку, и как отобразить эллипсоиды. Какие манипуляции вы имеете в виду?

 Профиль  
                  
 
 Re: Программа для химиков
Сообщение21.08.2014, 19:53 
Заслуженный участник
Аватара пользователя


18/05/06
13435
с Территории
На первый вопрос: контестное меню по правой кнопке - там UNITCELLMenu и потом UNITCELLnine.
Про эллипсоиды: вот как раз в нём-то их, кажется, и нет :D (А может, где-то есть - я его не весь знаю.)
Про манипуляции: если задать файл с симметрически независимой частью структуры, он может её операциями симметрии размножить до всей структуры. (Операции тоже должны быть заданы в том же файле.)

 Профиль  
                  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 9 ] 

Модераторы: photon, Toucan, Супермодераторы



Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group